Интегративный полный анализ генома выявил экспрессию черт, предсказывающих трансформацию фолликулярной лимфомы

Whole-genome integrative analysis reveals expression signatures predicting transformation in follicular lymphoma

Brodtkorb M, Lingjærde OC, Huse K, Trøen G, Hystad M, Hilden VI, Myklebust JH, Leich E, Rosenwald A, Delabie J, Holte H, Smeland EB.
Centre for Cancer Biomedicine, University of Oslo, Oslo, Norway

Трансфорированная фолликулярная лимфома (ФЛ) – более агрессивный вариант болезни с быстрым прогрессированием и смертью. Количество существующих молекулярных маркеров трансформации очень мало, и их клиническое значение ограничено. Проведен полный анализ генома ряда копий ДНК и профилей экспрессии генов на серии биопсий больных ФЛ.

Определено 698 генов с высокой корреляцией между экспрессией генов, числом копий генов и молекулярной сетью, обогащенной цис-связанными генами. Эта сеть включает в себя 14 цис-связанных генов, ассоциированных с патогенетическим путем NFκB. Для каждого из этих 14 генов гены-мишени NFκB пути определены и дана соответствующая бальная оценка. Баллы шести из цис-связанных генов NFκB пути (BTK, IGBP1, IRAK1, ROCK1, TMED7 – TICAM2 и TRIM37) были значительно связаны с трансформацией ФЛ.

Результаты показывают, что гены, регулирующие В-клеточную жизнедеятельность и активацию, участвуют в трансформации ФЛ.

Подготовила Е.П. Штырлина