Гематлас: характеристика экспрессии генов в дифференцированных клетках крови человека

A HaemAtlas: characterizing gene expression in differentiated human blood cells

Nicholas A. Watkins, Arief Gusnanto, Bernard de Bono, Subhajyoti De, Diego Miranda-Saavedra, Debbie L. Hardie, Will G. J. Angenent, Antony P. Attwood, Peter D. Ellis, Wendy Erber, Nicola S. Foad, Stephen F. Garner, Clare M. Isacke, Jennifer Jolley, Kerstin Koch, Iain C. Macaulay, Sarah L. Morley, Augusto Rendon, Kate M. Rice, Niall Taylor, Daphne C. Thijssen-Timmer, Marloes R. Tijssen, C. Ellen van der Schoot, Lorenz Wernisch, Thilo Winzer, Frank Dudbridge, Christopher D. Buckley, Cordelia F. Langford, Sarah Teichmann, Berthold Göttgens, Willem H. Ouwehand
Опубликовано: Blood, 7 May 2009, Vol.113, No.19, pp.1-9.

Гемопоэз – тщательно контролируемый процесс, регулируемый комплексом факторов транскрипции, которые частично контролируются сигналами, являющимися результатом связывания лигандов с поверхностью клеточных рецепторов. С целью раскрытия механизмов гемопоэза сравнили профиль экспрессии генов человеческих эритробластов, мегакариоцитов, В-клеток, Т-киллеров и Т-хелперов, НК, гранулоцитов и моноцитов, используя микрообразцы всего генома. Биоинформативные анализы этих образцов выполнены с фокусировкой внимания на факторах транскрипции, членах надсемейства иммуноглобулинов, специфичных для ростка транскриптах.

Обнаружено, что члены специфичных для ростка генов варьировали в 2 последовательных величинах, упорядоченных от 5 для Т-киллеров до 878 для гранулоцитов. Обнаружен новый характер коэкспрессии для транскрипции ключевых факторов, включая гемопоэз (GATA3-GFI1 и GATA2-KLF1). Представлен наиболее полный анализ экспрессии генов в гемопоэтических клетках и выявлены гены, играющие ключевую роль в дифференциации и функции клеток по определенному пути. Эти легко оцениваемые данные бесценны для дальнейших исследований гемопоэза и роли специфических генов и также позволят понять результаты современных исследований генома.

Подготовил Р. Ханвердиев,